鲁达 很多做科研实验/做课题报告的科研老师们在拿到全基因组测序数据之后要进行一系列的分析，但同时也担心数据庞大分析缓慢导致进度，也有因为不会编程不知道该如何进行拼接分析的...其实需要质控拼接、MLST分析及菌种鉴定等完全可以自己在平台上进行分析，下面以金葡菌为例进行了质控拼接及菌种鉴定等分析。
在操作前先来了解下什么是金葡菌呢？
网络图片（侵删）
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus，S. aureus)也称“金葡菌”，隶属于葡萄球菌 属，是革兰氏阳性菌的代表，为一种常见的食源性致病微生物。
金黄色葡萄球菌广泛存在于自然环境中，近几年金黄色葡萄球菌引发的食物中毒报道层出不穷，由金黄色葡萄球菌引起的食物中毒占食源性微生物食物中毒事件的 25%左右，金黄色葡萄球菌成为仅次于沙门氏菌和副溶血杆菌的第三大微生物致病菌。
那么在取得了金葡菌全基因组测序数据后要怎样分析呢？
首先查看了该测序数据的质控报告：
在上传了测序数据原始文件（以.fq为结尾的测序数据文件）后，可以看到有“质控”的标志
点“质控”之后可以看到报告结果
Per base sequence quality
Per sequence GC content
Sequence Duplication Levels
选择进行拼接分析，大概20-30分钟就可以分析出结果，对拼接结果可进行下载和基因注释：
金葡菌拼接分析结果
进行拼接分析后可以进行毒力、耐药分析，MLST分析及cgMLST分析及菌种鉴定分析。
金葡菌-菌种鉴定报告
金葡菌-krona图
在微生物数据分析平台还可进行聚类分析等~
原来一键就搞定krona图的方法这样简单