luda 88-89赛季，拜仁慕尼黑在海因克斯的带领下夺得德国德国足球甲级联赛冠军，但马特乌斯布雷默等球员转会意甲后，拜仁在欧足联冠军联赛赛场上的竞争力下降，因此1989年夏天拜仁投资160万马克，带领当时德国最佳后卫尤尔根科勒。
这一转会是非常关键的，科勒尔的到来，帮助拜仁再次杀入欧冠四强。但是在进入半决赛后，拜仁又遇到了强大的米兰，科勒再次面对老对手巴斯滕。在首回合比赛中，米兰主场获得一粒点球，巴斯滕一蹴而就取得先机，拜仁并没有获得客场进球。在第二回合比赛中，拜仁表现出色，科勒也没有再给巴斯滕任何机会。斯特伦次获得进球，将总比赛追成1比1。最终两队进入加时赛， 米兰前锋博格诺沃在101分钟挑射得分，取得客场进球，虽然麦金纳利随后为拜仁打入一球，但最终拜仁以客场进球劣势被淘汰。虽然很遗憾，但几天后，拜仁就卫冕了德甲冠军，这也是24岁的科勒尔第一次获得冠军奖杯，他和队友疯狂庆祝。
1990年世界杯，科勒尔作为西德队主力中后卫，主要还是盯防对手的得分手，小组赛阶段，西德队取得两胜一平头名出线，没想到荷兰队在f组取得小组第三勉强进入八强，直接面对西德队，科勒尔再次面对的他老熟人巴斯滕，这次他没有给荷兰人任何机会，一通死缠烂打将巴斯滕彻底冻结，而里杰卡尔德和沃勒尔的同归于尽，让西德队占据先机，最终西德队2比1击败荷兰晋级9强，赛后曾一直吐槽科勒尔动作粗野的巴斯滕承认，德国大汉是令他最难受的后卫，他的表现是世界级的。
在当时的规则下，科勒的防守确实很粗野，侧后方铲球是家常便饭，但是也不能否认，科勒防守的预判极好，补位及时，铲球精确，身体强壮，速度也不慢。在巴斯滕之后，他又让在小组赛打入五球的捷克斯洛伐克高中锋斯库赫拉维哑火，西德队1比0进入四强。半决赛科勒又面对英格兰神锋莱因克尔，布雷默率先为西德队任意球得分，科勒再次对莱因克尔进行贴身防守，但这次小个子的英格兰人还是夹缝求生，用一次挡拆甩开科勒尔得分，但是在之后的点球大战，西德队还是依靠钢铁版的意志获得了胜利。
1990年世界杯决赛，西德面对阿根廷，这场比赛科勒的压力却小了不少，一方面阿根廷队状态火热的卡尼吉亚停赛，对方进攻核心马拉多纳又由马特乌斯和布赫瓦尔德照顾。科勒尔面对的是阿根廷队的9号德佐蒂，实力并不突出。开场不久，阿根廷队的蒙松又被红牌罚下，西德队在场面上一直占据优势，在西德队依靠布雷默的点球获得领先后，被科勒尔盯防得非常郁闷的德佐蒂气急败坏，将科勒尔拉倒，也吃到了红牌，最终少两人的阿根廷队无力回天，西德队第三次获得世界杯冠军。
经过1990年世界杯的洗礼，科勒成为了世界足坛最炙手可热的后卫，虽然拜仁慕尼黑有6名球员是世界杯冠军西德队的成员，但是在90-91赛季中，他们却只获得了德甲亚军，冠军奖杯被凯泽斯劳滕夺走。91-92赛季，两德合并后德甲联赛面临重组，尤文图斯向拜仁后防线上两位大将发出了邀请，1991年夏天，科勒和鲁伊特一同转会尤文图斯，科勒的身价是400万马克，而鲁伊特是300万马克。
当时全世界最优秀的球员都汇聚到了意大利，但想要在意大利立足并不容易，鲁伊特就在一个赛季后回到了德国，而擅长防守的科勒却成了特拉帕托尼手下的爱将，和科勒搭档的是巴西后卫塞萨尔，那些世界级前锋的噩梦也开始了。91-92赛季赛季，当时的米兰是意甲最强的球队，但尤文图斯在和米兰的两回合较量中，平分秋色，两场1比1，科勒的表现极其出色，在首回合比赛结束后，巴斯滕和他交换了球衣，欢迎他来到意甲。日后，科勒在谈起巴斯滕是，他直言不讳，巴斯滕是真正的全能中锋，在我看来他比莱万更强。首个赛季，尤文图斯落后米兰8分获得联赛亚军，对于科勒而言，这是个不错的结果。
1992年欧锦赛，德国队也基本完成了新老交替，虽然马特乌斯因伤缺阵，但在两德合并后，萨默尔的加入让德国实力有增无减，但阵容还有待磨合，他们在小组赛首轮和前苏联1比1战平，却付出了沃勒尔受伤的代价，第二轮小组赛2比0击败苏格兰，在最后一轮，他们的再次遇上了荷兰队，这次的荷兰队明显有备而来，老帅米歇尔斯挂帅，荷兰三剑客全部到位，而荷兰新一代的进攻天才博格坎普的加入，让科勒尔有点顾此失彼，他还在比赛中吃到了一张黄牌，这是科勒参加三界大赛以来的第一张黄牌，可见其防守技术之精湛。最终荷兰3比1轻取德国，但是德国队还是以小组第二出线。
在小组出线后，德国队遇上了东道主瑞典队，福格茨队阵容进行了一番调整，此时的北欧海盗也是兵强马壮，锋线上的黑人壮汉达赫林，娃娃脸布洛林和高中锋安德森，不过德国队由哈斯勒任意球破门取得先机，此后里德尔梅开二度，德国3比2杀入决赛。本以为德国队将再次面对实力强大的荷兰，没想到荷兰在点球大战被黑马丹麦击败。始料未及的德国队在决赛中用科勒负责盯防小劳德鲁普，谁也没料到最可靠的队长布雷默在左路连续出错，德国队被丹麦0比2完爆，虽然科勒入选了本届欧洲杯最佳阵容，但他欧洲杯冠军泡汤。要想圆满，26岁的科勒，必须再等四年。