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【pcr检查是什么意思】奥密克戎变异那么多,核酸检测“揪出来”吗?

最近,中国疾病预防控制中心专家在谈到奥密克戎变异株检测时表示,根据对奥密克戎变异株的基因组分析,其变异点不在我国第8版《新型冠状病毒肺炎防控方案》中公布的核酸检测试剂引诱物和探针目标区域,不影响我国主流核酸检测试剂敏感性和特异性。

也就是说,虽然奥密克戎株的变异不少,但我国现有的核酸检测试剂也能准确检测到。记者审查了第8版《新型冠状病毒肺炎防控方案》附件中公布的核酸检测方法,发现目前新型新冠病毒核酸检测的主要目标是病毒基因组的开放阅读器箱1ab(ORF1ab)和核壳蛋白(N蛋白)。这些概念是什么意思?为什么不影响奥密克戎测试结果?对此,《解放日报》相关新闻记者采访了上海交通大学医学院上海市免疫学研究所王英教授,请他解释原理。

王英介绍说,新型新冠病毒有四种主要结构蛋白:刺突蛋白(S蛋白)、核壳蛋白(N蛋白)、膜蛋白(M蛋白)、包膜蛋白(E蛋白)。下图显示了病毒粒子上不同结构蛋白的分布。

引自kirtipal n et al.infection,genetics and evolution 2020

此外,以新型新冠病毒基因组编码的ORF1a和ORF1b蛋白是非结构蛋白,主要编码与病毒复制和转录有关的酶,有助于在新型新冠病毒宿主细胞中“激怒”。不同新型新冠病毒株的序列分析结果表明,ORF1ab的核酸序列比较稳定,变异概率较低。

奥密克戎突变的突变部位主要集中在刺突蛋白上,因此对编码N蛋白和ORF1ab蛋白的基因检测没有影响。例如,新型新冠病毒携带多种身份证件时,核酸检测就好像看到了身份证件,并“揭发”了一个名为新型新冠病毒的通缉犯。现有核酸检测根据新型新冠病毒身份证和护照信息判断“身份”,奥密克戎变动后主要变化的是驾照信息。当然不影响“身份”判断的正确性。

另外,如果同时探测两个目标,本身也会对核酸检测准确性给予“双重保险”。根据第8版《新型冠状病毒肺炎防控方案》,通过荧光RT-PCR检测,通过新型新冠病毒两个目标——开放读取箱1ab和核壳蛋白,在这两种情况下,实验室都可以确认标本主人为阳性病例。一个是,同一样本中的两个目标结果都是阳性的。二、两种标本(如同一人的鼻咽拭子和口咽拭子)同时表示单个目标阳性,或同一类型标本表示两次单个目标阳性。

如果核酸检测能准确地“揪出来”奥密克戎,为什么要针对重点群众多次核酸检测?王英介绍说,这主要与病毒负荷和采样部位有关。“第一次检查时,感染者病毒负荷不高,或者样本部位还没有感染新型新冠病毒。随着病毒在体内不断复制,病毒负荷增加,感染人体更多部位,核酸检测结果可能会从阴变成阳。”

专栏编辑:顾颖文编辑:施佳妮

资料来源:作者:西扎尼

关于作者: luda

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