在新冠核酸的快速检测中,NGS检测通过直接从样品中提取的DNA和/或RNA逆转录后的文库构建及痛苦测量顺序,进行生物信息学分析。新冠核酸的快速NGS检测过程大致可分为核酸提取、文库建设、机器测序、生信分析、报告解释等五个阶段。
(源网络)
快速检测新冠核酸的PCR原理被用来放大与天然DNA复制过程相似的两个已知序列之间的DNA片段。采用扩增的DNA分子作为模板,引入与模板5 '端和3 '端互补的寡核苷酸片段。在DNA聚合酶的作用下,根据半保守复制机制,沿着模型链延伸,直到新的DNA合成完成为止。重复这个过程,大象DNA片段会放大。在快速检测新冠核酸的PCR检查之前,必须经过样品预处理、核酸扩增等阶段。
(图源网络)
简而言之,用于快速检测新冠核酸的NGS检测将病毒的遗传物质DNA或RNA与现有数据进行比较,通过结果比较来判断是否包含病毒。PCR检查是以指数方式复制病毒的特异性核酸片段,放置荧光标记,标记特异性片段,检测是否含有病毒。
那么,这两种方法学对目前流行的新型新冠病毒防治有什么作用呢?
我们都知道,预防传染病离不开新冠核酸的快速检测,我们经常接触到的新冠核酸的快速检测是通过PCR扩增来实现的。它在预防传染病方面具有不可替代的地位。
那么,用于快速检测新冠核酸的NGS检测又在防控中发挥了什么作用呢?
新冠核酸快速检测NGS主要是疫情防控中的病毒基因序列监测、实时监测、病毒变化监测,这样,前甲型病毒、德尔塔病毒、现在的Omicron病毒,都通过NGS的手段,对其基因序列进行比较、发现突变点、病毒发展的一种精密分类和跟踪与监测、疫苗开发、疫苗开发。
PCR和NGS技术在检测新冠突变方面有各自的优点和很强的互补性。
与NGS技术新冠核酸相比,PCR的检测速度更快,简化了操作程序,降低了成本,更适合大规模检测。NGS分析了病毒对毒株的全部序列,对传染病追踪及流行病学研究具有重要作用。
但是,在目前的情况下,用于快速检测新冠核酸的PCR检测仍然是疫情防控中流砥柱,其地位是不可替代的。不仅充分方便,目前PCR技术已经成熟,随着新冠核酸快速检测技术的出现,疫情防控能力、高效扩增试剂、便携式放大器的出现,发热门诊、机场海关等场景检测更加高效,疫情防控能力进一步提高。