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首先想到的肯定是黑衣人组织。我们的主人公向黑衣人组织的琴库注入药物，使身体变小，化身柯南，军队成员都以酒的名义，有基尔、科恩、波本、锦州、伏特加贝尔莫德等。但是这个组织有点悲伤，很多人躺在底层。
晓，火影里最强大的组织，团队作战灭掉任何一个大国肯定不是问题，穿着绣有红云的黑色风衣，佩戴着按照中国星宿排的戒指，主要成员：长门、小南、宇智波鼬、宇智波带土、蝎等，晓中每个成员都有不同的象征意义。
护庭十三队，尸魂界最重要的组成部分，由第一番队长山本柳元斋建立，群成员有蓝染（叛变的大boss）、市丸银、卯之花烈、日番谷冬狮郎、朽木白哉、更木剑八等等、个人还是比较喜欢朽木白哉。
幻影旅团，这是小编初中看华娱卫视看的动漫，出自全职猎人，是一个是13人的盗贼组织。全球知名的强盗集团，以蜘蛛的图案为其标志。他们为了夺取一切想要的东西可以大开杀戒对于和自己无关的人也不会有一丝的同情心。群成员有西索、窝金等。顺便说一下这是富坚义博的动漫作品哦。
凉宫春日的忧郁里的sos团，目的是让世界变得更热闹，群成员有凉宫春日、古泉一树、长门有希等、比较中二。。。不过我喜欢哈哈
日本动漫里最牛的组织出现了，就是风纪委员，某科学的超电磁炮、家庭教师reborn等里都出现了他们的身影，职责是维护学校的治安，但是为什么那么拽。。。
调查兵团，出自进击的巨人，战斗力超强，长期在墙外捕杀巨人，不过也造成了很大的伤亡。
黑色骑士团，出自叛逆的鲁路修，由zero所率领，以正义的使者为宗旨。
万事屋来镇楼，最穷最屌丝的组织，没有之一！