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枯山水似乎是世界的缩小，如此干练简洁，在表象上与现代主义、抽象和极简主义的观点非常接近。
基因一：缩景术
第一个基因是缩景术，属于中国古人向往的神仙术之一,缩景术直接产生的“观法”即是“以大观小”，缩千里于盆池，它的物质成果最常见的就是“盆景”。在汉代，山水盆景、盆石、碗峰之类，就已经比较流行了。盆景是枯山水的基因之一。
基因二：禅宗的观法
第二个基因是禅宗的观法，禅宗的观法要求跳出时空看问题，在一种高度上看，在一个大的时间跨度上看。好比在太空看地球，你会发现这个世界是静止
的，江不流，云不动，没有人，不喧嚣，非常安宁，种超然的视野，看一千里，看一千年。在这样的视野下，世界的表现就是一种“凝”，注意不是止，而是“凝视”，既是过去，也是未来。那个白沙反映的就是一个一干里眼下的水态，一千年流转的凝集呈现。枯山水多用在寺庙里，围绕方丈而营造，虚拟了一个非常观的世界，提醒你在修行，宗教场所需要有个特殊的情境包围来。
基因二：日本祭神场
第三个基因，是和日本本土的祭神场所有关。为何枯山水里有大量的置石，几乎没有掇山? 为何是大量的白沙? 白沙不是只有日本人有，我们唐宋时期在铜盆里撒白沙置石就有了。白沙比较容易反映一个固态凝结的水面，是想象化的水面，与呈贡的物品形成反差衬托。
日本的民族多傍海而居，他们的生活离不开“白沙洲滨”，就是沙滩。食物来源于海，他们对于大海是崇拜的，很多神庙和圣迹都在海边。白色既具象，又很抽象，是干净和圣洁的代言。说像沙滩，到置石，西方有巨石阵，很多民族原始时期都以巨石来建立一个祭祀的场所，日本通常把巨石作为神性的象征。下面一个磐石，上面有一个石柱，这就是一个神的指代了。
所以，日本庭园中的置石，不能简单类比于我们中国园林中叠石与掇山，他们的置石即是置神，是神的位置的摆放与确立，是三圣，是蓬莱，是龟岛，是鹤岛。或者再直白一点讲，就是牌位，只是被自然化了。所以，置石是有禁忌有风水说法的。既然是神位，就不能去触碰冒犯，所以枯山水不可踏入，更不能坐在石头上。这一点与我们的园林很不一样，我们要与山石发生亲近的关系，甚至将它们看作室外的家具。
现代枯山水